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地质调查研究院于2000年12月15日经第六次校长办公会研究决定成立的，是以组织与实施国土资源大调查地质调查项目和承担地质勘查资质相关地质项目为主的综合性科研机构，地质调查研究院由综合办公室 、总工程师办公室、资质与项目管理办公室和财务管理办公室等组成。
地质调查研究院负责制定并组织落实学校地质调查工作发展规划和管理政策； 负责国土资源大调查地质调查项目和地质矿产调查评价专项项目的组织、论证、申报和项目管理。负责与地质勘查资质相关项目的管理工作。负责地质勘查资质认证申请、年度复审及资质的管理使用。吉林省地质学会的日常管理工作。
作为校内具有管理职能的单位，我们以服务为宗旨，加强地质调查项目的组织和管理，紧密围绕学校整体发展规划，密切结合国家需求，通过组织学校多学科优势，在地质、资源、环境等研究领域形成特色的研究团队；在地质调查方面，形成稳定地区、稳定队伍，在国家地质调查领域建立一支具有重要影响的队伍。